Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms