Protein–RNA interactions for Protein: Q80W93

Hydin, Hydrocephalus-inducing protein, mousemouse

Predictions only

Length 5,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HydinQ80W93 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HydinQ80W93 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms