Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsm4Q80W40 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms