Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja2Q80U04 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms