Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42bpbQ7TT50 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms