Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms