Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmQ7TSN2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms