Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms