Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms