Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actn1Q7TPR4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms