Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ShprhQ7TPQ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ShprhQ7TPQ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms