Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmc8Q7TN58 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmc8Q7TN58 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms