Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf139Q7TMV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf139Q7TMV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms