Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms