Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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