Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27Q6ZWU9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27Q6ZWU9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms