Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms