Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl9Q6ZPT1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms