Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc44a1Q6X893 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc44a1Q6X893 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms