Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift172Q6VH22 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms