Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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Atp8b3Q6UQ17 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atp8b3Q6UQ17 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atp8b3Q6UQ17 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atp8b3Q6UQ17 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atp8b3Q6UQ17 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b3Q6UQ17 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Atp8b3Q6UQ17 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms