Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms