Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc154Q6RUT8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms