Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gramd2bQ6PEM6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms