Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfrlQ6PE55 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms