Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf1cQ6PDZ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms