Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms