Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms