Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Papd7Q6PB75 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms