Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gapvd1Q6PAR5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms