Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab2Q6PAM0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab2Q6PAM0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms