Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bend3Q6PAL0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bend3Q6PAL0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms