Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms