Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slf2Q6P9P0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms