Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms