Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp12Q6P5B0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms