Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam222bQ6P539 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam222bQ6P539 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms