Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab6Q6P1E8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab6Q6P1E8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms