Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rprd2Q6NXI6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms