Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms