Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms