Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc66Q6NS45 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc66Q6NS45 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms