Protein–RNA interactions for Protein: Q6J1H4

Utf1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utf1Q6J1H4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utf1Q6J1H4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms