Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5416Q6IE28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm5416Q6IE28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm5416Q6IE28 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5416Q6IE28 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms