Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hecw2Q6I6G8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms