Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6GQU0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6GQU0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6GQU0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms