Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil1Q6EDY6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms