Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms