Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scaf8Q6DID3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms