Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp11bQ6DFW5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp11bQ6DFW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms